Genepidgin yra Python įrankių, kurie padeda į vertinimo ir priskyrimo genų produktų pavadinimų Suite & nbsp; Yra trys pagrindinės dalys.:genepidgin * švaresnis *& Nbsp; standartizuoja genų vardus per UNIPROT pavadinimų gairesgenepidgin * palyginti *&...
ŽINGSNIAI yra už miesto stochastinio modeliavimo sistemų reakcijos-difuzijos į savavališkai sudėtingų 3D geometrijos paketas. Mūsų pagrindinė modeliavimas algoritmas iš Gillespie anketa SSA įgyvendinimas pratęstas susidoroti su difuzijos molekulių daugiau...
TRMiner yra Python programa, kuri siekia mokslo duomenų kuratorių, & nbsp;. Tai leidžia greitai genėti dideles kolekcijas mokslinių publikacijų ir sakinių atitinkamas tam tikros kasybos tikslas.Tai pasiekiama dviem etapais. Pirma, tekstai tranlated į...
Bioinformatikos Palyginamasis sistema yra bandymas sukurti protingą testavimo sistemą, testai, ir duomenis, kad galutiniai vartotojai ir pardavėjai zondas savo sistemų veikimą.Ką mes bandome padaryti, tai sukurti testavimo sistemą ir pagrindinę rinkinį...
Staden paketas yra visiškai išvystyta rinkinys DNR sekos surinkimas (Gap4), redagavimo ir analizės įrankiai (skiriamųjų) Unix, Linux, MacOSX ir MS Windows.Dėl Gap4 priekio Yra buvę keletas nepilnametis prisijungti susijusiospatobulinimai, kaip jis balai...
AREM yra pagrįsta ant Mac "(modelis, pagrįstas analizės dėl Chip-Eil duomenis).Didelio našumo sekos sujungtas su chromatino immuno- kritulių (lusto Eil) yra plačiai naudojamas charakterizuoti pločio genomo privalomus modelius transkripcijos veiksnių,...
seriesoftubes yra išplėstinis dujotiekio Solexa lustas tolesnius duomenis.Pakuotės Dokumentacija Reikalavimai : ...
MetagenomeDB yra Python biblioteka skirta lengvai laikyti, gauti ir komentuoti metagenomic sekas & nbsp;. MetagenomeDB veikia kaip abstrakcija sluoksnio viršaus MongoDB duomenų bazę. Ji suteikia API kurti ir modifikuoti ir prijungti dviejų tipų objektų,...
Seal Python modulis, kuris suteikia sekos suderinimą Hadoop.Sandarinimo yra MapReduce paraišką biologinės sekos derinimą. Jis veikia Hadoop (http://hadoop.apache.org) per Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce ir HDFS API Hadoop. ...
Sojų pasta (mišinys izoformų) yra tikimybinis sistema parašyta Python kad quantitates raiškos lygį & nbsp; ir alternatyviai sujungta genų iš RNR-Seq duomenis ir nustato skirtingai reguliuojamų izoformų ar egzonų visoje mėginių.Modeliuojant generatyvinių...
