Šveicarijos PdbViewer (dar žinomas kaip DeepView) yra programa, kuri suteikia patogią sąsają, leidžiančią analizuoti keletą baltymų tuo pačiu metu. Baltymai gali būti iškaltas siekiant pasiremti struktūrinių suderinimai ir palyginkite aktyvias svetaines ar kitas atitinkamas dalis. Amino rūgštis, mutacijos, H-obligacijos, kampai ir atstumai tarp atomų yra lengva gauti, dėka intuityvaus grafinio ir meniu sąsaja.
Šveicarijos PdbViewer (dar žinomas kaip DeepView) buvo developped nuo 1994 Nicolas Guex. Šveicarijos PdbViewer yra glaudžiai susijęs su Šveicarijos Modelis, automatizuotą Homologinis modeliavimas serverio sukurta per Šveicarijos instituto Bioinformatikos (SIB) prie struktūrinių Bioinformatikos Group "Biozentrum Bazelyje.
Darbas su šių dviejų programų labai sumažina darbo krūvį, reikalingą sukurti modelius, kaip tai galima sriegis baltymų pirminę seką ant 3D šabloną ir gauti nedelsiant atsiliepimus apie tai, kaip gerai sriegiu baltymas bus į orientacinę struktūrą priimta prieš pateikiant prašymą sukurti trūkstamas kilpas ir patobulinti sidechain pakavimas.
Šveicarijos PdbViewer taip pat gali skaityti elektronų tankio žemėlapius ir teikia įvairias priemones, statyti į tankį. Be to, įvairūs modeliavimo įrankiai integruotos ir komandų failus populiariausių energijos mažinimo paketai gali būti sukurtas.
Galiausiai, kaip speciali priemoka, POV-Ray scenos gali būti gautos iš dabartinės nuomone, siekiant padaryti apsvaiginimo-ray atsekti kokybės vaizdus.
Kas naujo , šioje laidoje:
- Timinas C6 atomas dabar teisingai pakrauti
- Fiksuotas POV-Ray produkcijos begalinis kilpa ant PC versija
- kartais avarijos, o taupyti PBP failus (pvz 2i37) ant PC buvo nustatytas
- Atnaujinta iš Upsalos elektronų tankis Žemėlapis Server adresas
Komentarai nerastas