BioRuby

BioRuby suteikia integruotą aplinką bioinformatikos (Biologija Informacija mokslas).
Objektinis programavimo kalba Ruby turi daug funkcijų, tinka bioinformatikos tyrimų, pavyzdžiui, akivaizdu, sintaksė išreikšti sudėtingus objektus, reguliarios išraiškos teksto tvarkymo tokia galinga, kaip Perl & rsquo; s, įvairių bibliotekų, įskaitant interneto paslaugų ir tt
Kaip Ruby sintaksė yra paprasta ir labai švarus, mes manome, kad tai yra lengva išmokti pradedantiesiems, paprasta naudoti biologų, taip pat pakankamai galinga programinės įrangos kūrėjams.
Be BioRuby, kūrėjas gali gauti biologinių duomenų bazės įrašus iš plokščių failus, Internet Web serverių ir vietos reliacinių duomenų bazių.
Šios duomenų bazės įrašai gali būti patikrintas, išgauti reikiamą informaciją. Biologiniai sekos gali būti gydomi pripildyto metodų Ruby & rsquo; s Styginių klasė ir reguliarios išraiškos.
Biblioteka gali būti integruota su įrankiais, kaip sprogimo FASTA hmmer ir daug kitų programinių paketų, skirtų biologinei analizei.
 BioRuby remia pagrindines biologinės duomenų bazių formatus ir suteikia daug būdų susipažinimo juos per flatfile indeksavimo, SQL, Web Services ir kt Įvairūs interneto paslaugas, įskaitant KEGG API gali būti lengvai naudojamas pagal BioRuby.

Savybės :

• BioRuby Shell "
• API
• Dokumentacija

Reikalavimai :

• Ruby 1.8.7 arba naujesnė