Mobilusis Elektrofiziologija Modeliavimas Aplinka (CESE) yra išsamus sistema specialiai sukurta siekiant atlikti skaičiavimo elektrofiziologinius išvaizdą, pavyzdžiui, modeliavimas širdies miocitų elektrinio aktyvumo.
Mobilusis Elektrofiziologija Modeliavimas aplinka yra naudinga modeliavimas veikimo potencialo, atskirų jonų sroves ir pokyčių joninių koncentracija.
CESE yra cross-platform programa, ji veikia bet sistema, kuri turi "Java Runtime Environment (JRE) 1.4 arba naujesnė versija. Ji buvo išbandyta ant Windows, Linux, Solaris, MacOS X, ir AIX.
CESE vartotojai
CESE yra integruota aplinka atlikti skaičiavimo modeliavimas naudojant elektrofiziologiniais modelių įvairovė.
Šiame etape CESE leidžia kurti ir vykdymą vieno elemento modelių (kurių sudėtyje yra tiek Hodžkino Huxley (VV) ir Markovo dabartines formuluotes). Modeliai elektrinio aktyvumo širdies ląstelėse, kurių šaltinio kodas yra įtraukti į CESE platinimo. Tikimės išplėsti turimų modelių skaičių ir įtraukti tam tikrų neuronų modelius ateityje.
Pagrindinis stiprumas CESE yra jo vienodumo & # 65.533; Sąsaja programa išlieka skirtingų tipų modelių pati. Jūs galite lengvai persijungti tarp modelių ir palyginkite modeliavimo rezultatus. Modelis parametrai gali būti modifikuoti, parinktas išvesčiai ir / arba suspaudžiamas pačiu, standartiniu būdu.
CESE išplečia tradicinį elektrofiziologinis prasmę "įtampos gnybto". Galite pakaba beveik bet koks modelis kintamasis, įskaitant įtampos (membranos potencialo), visiškus arba atskirų jonų sroves, jonų koncentracijos, temperatūros, strobavimo kintamuosius ir tt užspaudimo komandos gali būti sudėtingas gabalas-protingas funkcijų, individualiai rinkinys modelio kintamojo interesų , Tai atveria begalines galimybes kompleksiškai modelio elgesį tirti.
CESE suteikia paprastas, bet veiksmingas duomenų vizualizacijos. Modeliavimo rezultatai gali būti pateikiami grafikos ir lentelėse formų. Sklypai gali būti pritaikytas ir regionų interesų Mastelis.
Nors CESE nebuvo skirta būti duomenų analizės įrankis, galite generuoti srovės įtampos santykius (I-VS) ir apskaičiuoti statistinius parametrus tam tikrą signalą programą. Galite eksportuoti duomenis į ASCII, Aksonas Tekstinis failas (ATF) ir netcdf formatai tęsti analizę savo mėgstamą paketą.
CESE kūrėjai
CESE buvo sukurtas nuo žemės iki įtraukti geriausi programavimo patirties, kad Java programuotojams, tiek vartotojo sąsajos nuoseklumo ir kodo aiškumo ir pakartotiniam naudojimui. Jei įmanoma, CESE remtis turimais Java API (pvz Java2D, JavaBeans, JAXP) supaprastinti kodą.
Modelis kūrimas reikalauja namas palaikymo funkcijų turi būti koduojami ir # 65.533, skaičių; jie apima ODE integratorius, kasdienybe tvarkymo modelio parametrus, taupyti / atkurti modelio būklę, vizualizuoti modeliavimo rezultatai ir tt CESE suteikia jums įgyvendinti šių kasdienybe, vadinasi, galite sutelkti dėmesį rašyti konkrečiam joninės srovės (-ių) kodą ir CESE atliks visa kita.
CESE ne bando sukurti sudėtingas programavimo pagrindus savo ir # 65.533; Greičiau, jis naudoja pagrindinius Java API. Pavyzdžiui, modeliai yra Java dalys, atitinkančios JavaBeans specifikacija. Mes naudojame XML nurodyti užspaudimo komandas, ir Java objektas Publikacija išsaugoti / atkurti modelio parametrus.
Kas naujo šioje versijoje:
Komentarai nerastas