The Chemistry Development Kit

Programinė įranga Screenshot:
The Chemistry Development Kit
Programinė detalės:
Versija: 1.5.13 Atnaujintas
Įkėlimo datą: 26 Apr 16
Kūrėjas: The CDK Project
Licencija: Nemokamai
Populiarumas: 36

Rating: 3.7/5 (Total Votes: 3)

Chemija Development Kit (taip pat žinomas kaip CDK) yra nepriklausomas nuo platformos, laisvai platinamas ir atviro kodo biblioteka programinė įranga įdiegta Java ir specialiai struktūrinių bioinformatikos, cheminformatics ir skaičiavimo chemija.

Projektas susideda iš įvairių naudingų algoritmų ir duomenų struktūrų, pritaikytas specialiai programuotojų, kurie nori sutaupyti daug laiko ir pastangų išnaudodami kodą. Chemijos Development Kit nėra skirta būti naudojamas galutiniams vartotojams.


Funkcijos iš pirmo žvilgsnio

Pagrindinės funkcijos apima paramą skaitymo ir rašymo cheminės duomenų formatus, parama teikiant chemines struktūras, parama QSAR (kiekybinis struktūros & ndash; aktyvumo santykis). Aprašus, taip pat įmontuotą algoritmai paremti cheminę grafų teorijos

Jūsų patogumui, paraiška yra paskirstomas iš anksto pastatytas dvejetainius indelį formatu. Norėdami jį naudoti savo projektą, tiesiog atsisiųsti naujausią stabilią versiją iš Softoware naudojant aukščiau esančią nuorodą, kur taip pat galite rasti programą & rsquo;. S Source siuntiniai

Programuotojai rasite išsamią informaciją apie tai, kaip sudaryti programą iš šaltinių, kaip paleisti įvairius bandymus, taip pat, kaip jį naudoti kitose programose readme.txt faile, yra viduje tar.gz archyvą.


Po kapotu ir palaikomų OS

Atsižvelgiant išvaizdą prie CDK gaubtu (Chemija Development Kit) programinę įrangą, mes galime paminėti, kad ji buvo parašyta visiškai Java programavimo kalba.

"Šiuo metu ji yra visiškai suderinama su 32 bitų ir 64 bitų skonių GNU / Linux, Microsoft Windows ir Mac OS X operacinėms sistemoms. Tačiau ji turėtų dirbti bet OS palaiko Java Runtime Environment (JRE) & nbsp; ir Java Development Kit (JDK) & nbsp; technologijas

Kas naujo šioje versijoje:

  • oficialių kaltinimų dėl IAtomcontainer perkeliamas į IMolecularFormula
  • Ištaisyta klaida 2787332 Senas obligacijų masyvas Gasteiger mokesčio apskaičiavimo buvo nustatytas;
  • Atnaujinta nustatyti klaidą 2788357 SMARTSQueryTool dabar pagauna TokenMgrError į CONSTRUC
  • pridėjo naują taglet apdoroti cdk.githash žymeklį ir nuorodą Javadocs šaltinių ir Git atpirkimo;
  • Atnaujinta cdk.svnrev žymeles cdk.githash žodžius;
  • Bug_2787332. Pridėta tyrimas triklozano molekulės (Inchi = 1S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
  • Pašalinta pasenęs Rendererze kodas: arba naudoti CDK-1.0.x arba jchempaint ugdymo;
  • Pridėta testas klaidą 2786624 į analizatorius bandymų komplektą;
  • Naudingos nuorodos į PMD puslapiuose,
  • Pridėta nuoroda junit statistika,
  • Pridėta sąrašą klasių moduliu, su nuorodomis į klojimo @ Pele,
  • patalpintas įsteigta sukurti modulį HTML puslapius;
  • patalpintas įsteigta sukurti modulį HTML puslapius;

Kas naujo versiją 1.5.10:

  • oficialių kaltinimų dėl IAtomcontainer perkeliamas į IMolecularFormula
  • Ištaisyta klaida 2787332 Senas obligacijų masyvas Gasteiger mokesčio apskaičiavimo buvo nustatytas;
  • Atnaujinta nustatyti klaidą 2788357 SMARTSQueryTool dabar pagauna TokenMgrError į CONSTRUC
  • pridėjo naują taglet apdoroti cdk.githash žymeklį ir nuorodą Javadocs šaltinių ir Git atpirkimo;
  • Atnaujinta cdk.svnrev žymeles cdk.githash žodžius;
  • Bug_2787332. Pridėta tyrimas triklozano molekulės (Inchi = 1S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
  • Pašalinta pasenęs Rendererze kodas: arba naudoti CDK-1.0.x arba jchempaint ugdymo;
  • Pridėta testas klaidą 2786624 į analizatorius bandymų komplektą;
  • Naudingos nuorodos į PMD puslapiuose,
  • Pridėta nuoroda junit statistika,
  • Pridėta sąrašą klasių moduliu, su nuorodomis į klojimo @ Pele,
  • patalpintas įsteigta sukurti modulį HTML puslapius;
  • patalpintas įsteigta sukurti modulį HTML puslapius;

Kas naujo versijos 1.2.2:

  • Fiksuoti nuorodos. Optimalus, nes kelias dar kieta į vieną Para Pavyzdžiui, bet mes neturime XML sistemą dar apibendrinti dalykus per visus Nightlies (veikia;
  • Atnaujinta versijos numeris;
  • Pridėta bandymas užtikrinti IAtomContainers nėra spėję via IMoleculeSet.add (IAtomContainerSet),
  • perrašyti addAtomContainer (IAtomContainer, dvivietis) taip pat, kad mesti IllegalArgumentException kai ne IMolecule praėjo
  • Dabar metimų IllegalArgumentException, kai ji bandė išsaugoti žinutę IAtomContainer kuris nėra IMolecule
  • Pridėta vienetas testas # 2784182;
  • naujas testas su rezerpino,
  • Pridėta taglets sriegimo saugumą;
  • Su vienu atomo ar mažiau, mes nustatome, kad jis būtų prijungtas, nes nėra atitvarų reikia (pataisymai # 2.784.209, NullPointerException ant IAtomContainer be atomų),
  • Pridėta vienetas testas bug # 2784209 šiuo metu nepavyksta,
  • Daugiau pašalinimas aiškiai org.openscience.cdk paketų pavadinimus: metimų sąlygas;
  • Daugiau pašalinimas aiškiai org.openscience.cdk paketų pavadinimus;
  • Daugiau pašalinimas aiškiai org.openscience.cdk paketų pavadinimus: naujos org.openscience.cdk.Foo () ragina
  • Pašalinta aiškių org.openscience.cdk.interfaces paketai pavadinimai (pataisymai # 2.783.549),
  • Pašalinta intymias pavadinimuose paketų, naudai importą, už org.openscience.cdk į datadebug modulio (pataisymai # 2.783.549),
  • Pašalinta intymias pavadinimuose paketų, naudai importą, už org.openscience.cdk į duomenų modulio (pataisymai # 2.783.549),
  • Breakout iš rekursijos galimybe ant AllRingsFinder
  • Gavyba iš styginių elementinio formulę mokestis.
  • Gavyba iš styginių elementinio formulę mokestis.
  • valdiklis iš masės, kai ji yra iš intervalo
  • Atnaujinta protingai pridėti O s į PLANAR3 N, nustato triktį 2.781.199;
  • Pridėta išbandymu klaidą 2781199;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • skambučiai į CDKException konstruktorius pagamintas per sugavimo blokas dabar yra root išimtis išsaugoti kamino pėdsakus;
  • Pridėta vieneto testas užtikrinti SD laukai skaityti visų molekulių;
  • suskaidytas testas;
  • nauji failai,
  • daugiau bandymų LML skaitymas;
  • patalpintas vienetas testas # 1848591: Neteisingas Murcko sistema;
  • Fiksuotas dauguma, pašalinti nereikalingas visą paketą vardą,
  • Pridėta vienetas testas # 2692107;
  • Fiksuotas klaidos: nėra "S"

Kas naujo versijos 1.2.1:

  • Ištaisyta klaida 2.714.283, kuris tinkamai metimų išimtį, kai žiedai nėra tinkamai uždarytos. Jei žiedas yra neuždarytas su atitinkamu žiedas skaičius, InvalidSmilesException išmetama. Rungtynės Dienos elgesys;
  • Ištaisyta klaida 2729120 ir pridūrė vieneto testas;
  • Atnaujinta komentaras nustatyti klaidą 2768643.
  • Dalinis fix klaidą 2719237. Pagaminta getBondOrderSum statinio, pridėtinės vieneto bandymą jį;
  • Typo: proteinl - & gt; baltymų,
  • Pagamintas klasės viešajam, kad Nelūžis į statyti pridedant jį / *. Javafiles
  • Dalinai fiksuoti SMARTS atitinkančių už R0. Atnaujinta tikslas molekulė iniciacijos aiškiai nurodyti atomų ne žiedas, o taip pat atnaujintą RingMembership atomą daryti aiškų čekį, kai R0 yra nurodyta. Dalinai nustato triktį 2587204;
  • Fiksuotas įtartina lygybės testas. Privatus metodas buvo patikrinti Dvigulės objektus per nuoroda. Dirbo gerai, kai jie buvo niekinis. Nepavyksta, kai mums reikia lyginti pagal vertę. Kodas atnaujinama atsižvelgti į ją. Pridėta vieneto testas (ir padarė būdas apsaugoti taip, kad ji gali būti išbandyta),
  • Pridėta bandymo metodas anotacija. Baigia aprėptį duomenų modulio;
  • išimant ChiIndexUtils kad ji pakuoja privatus. Valo visuomenės API, nes jis naudojamas tik chi deskriptorių kodą. Atnaujinta visiems išlaikomiems klases. Perkelta bandymo kodas (kuris turi būti užpildyti!), Taip pat "
  • Kodas išvalymas ChiIndexUtils. Perskaičiuotas 1,5 idiomos,
  • Švaraus sudaro PathTools ir pridūrė, bandymo metodas anotacija, kad branduolys yra visiškai padengtas
  • Fiksuotas ankstesnis įsipareigoti redaguoti cdk.keyword liniją, o ne cdk.module linija
  • Daugiau nuoseklūs raktiniai žodžiai "
  • Pridėta testą siekiant užtikrinti, kad Integer objektai lyginami pagal vertę, o ne nuoroda,
  • Pridėta bandomąją bylą patikrinti, kad atomas konteinerių diffs yra teisinga tada, kai naudojant deserialized objektus;
  • Fiksuotas IntegerDifference, kad ji iš tikrųjų tikrina sveikasis vertės, o ne nuorodos į Integer objektą. Išspręsti problemą, kuriuo objektas Serijinis į diską ir tada deserialized neatitinka originalų objektą (pvz, ne tuščia skirt eilutė),
  • Taikomoji patch # 2675819 (Stefanas Kuhn): pleistras pridėti removeReaction į reactionSet
  • naudoti sąsaja, o ne įgyvendinimo;
  • Pašalinta nepanaudotas importas;
  • Naudoti IAtomContainer vietoj IMolecule, kaip faktinis atitikimas yra naudojant IAtomContainers jau (pataisymai # 2.686.249),
  • Ištaisyta ClassCastException (pataisymai # 2.685.134),
  • Pridėta šaltinis attrib nustatyti pastato Ubuntu .deb
  • Fiksuotas Padėkite sukurti sistema: naudokite doclet stiklainius develjar /; atnaujintas naujos src aplanko src / Pagrindinis; pašalinama labai pasenusi naudojimas rt.jar
  • Pašalintos libdepends apimti, bandymo ioformats, kuri nėra iš tikrųjų turi libdepends
  • Atnaujinta taip, kad jei taikinys atomas neturi simbolį (pavyzdžiui, pseudo atomų) rungtynės False (o ne NPE),
  • Fiksuotas tinkamas tvarkymas #N SMARTS užklausomis;
  • Pridėta išbandymu klaidą 2686473;
  • Pridėta pastaba dėl Ant 1.7.1 reikalaujama,
  • Ištaisyta NPE šaltinis: "niekinis == 2" sukelia išimtį, todėl pirmiausia testą nullness
  • Fiksuotas autorinės teisės pranešimas 2009;
  • Fiksuotas dublikatas saugojimas išdėstymo šablonus, kurie priklauso tik SDG modulio, o ne papildomo modulio per "
  • Merge filialas ../../ git-svn / CDK
  • 'local1.2 "

Kas naujo versijos 1.2.0:

  • Išspręsti keletą protas gramatikos problemos naudojamos dvi -letter simboliai ir IPseudoAtom į Fingerprinter ir prideda 4 naujas atomas tipo apibrėžtis, dėl jodo ir sieros.

Kas naujo versija 1.1.5.

  • Dažniausiai pataisymai;

Kas naujo versija 1.1.4.

  • Dažniausiai maži pataisymai;

Kas naujo Versija 1.1.1:

  • Dažniausiai maži pataisymai ir bendras kodas išvalyti.

Kas naujo versija 1.1.0.

  • Daug, daug pokyčių,

Reikalavimai

  • "Java 2 Standard Edition Runtime Environment"

Panaši programinė įranga

Fityk
Fityk

20 Feb 15

Razi
Razi

11 May 15

Mychem
Mychem

14 Apr 15

SimSoup
SimSoup

3 Jun 15

Komentarai The Chemistry Development Kit

Komentarai nerastas
Pridėti komentarą
Pasukite ant paveikslėlio!