CaPSID

kapsidė yra išsamus atviro kodo platforma, kuri sujungia didelio našumo skaičiavimo dujotiekio patogenas sekos nustatymo & nbsp; ir charakterizavimas žmogaus genomų ir transcriptomes kartu su keičiamo dydžio rezultatų duomenų bazės ir patogi žiniatinklio RKV programinės įrangos, užklausų ir vizualizuoti rezultatus.
Pradedama "
Jums reikės MongoDB duomenų bazės, Python 2.6+ montavimas ir Apache Tomcat 6+. Norėdami gauti daugiau informacijos, perskaitykite wiki:
http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

What naujo , šioje laidoje:

• korekcija Klaidos pranešimas, kai veikia atimties ir derinimą nerastas
• Daugiau darbai nustatymo ilgai veikia užklausų

Kas naujo versijos 1.4.2:

• Pašalina MongoKit priklausomybė

Kas naujo 1.4.1 versijoje:

• Išspręsti žymeklis Laukti ilgai veikia statistikos užklausų

Kas naujo versijos 1.4.0:

• nuotraukai statistika kol jie paleisti, o ne visiems pabaigoje
• Taupo unikalų identifikatorių genų kaip uid

Kas naujo versijos 1.2.7:

• Išspręsti README

Kas naujo versijos 1.2.6:

• Atimtis išfiltruoja padarytą žemėlapyje statant priskirti skaito

Kas naujo 1.2 versijoje:

• Naudingumas sukurti FastQ failus iš padarytą žemėlapyje skaito
• Naudingumas grįžti sankirtos FastQ failus
• Naudingumas grįžti filtras FastQ failus
• Pridėta mapq riba vėliavą atimtis
• Gbloader dabar gali įkelti bakterijų ir grybelių sukelta genomus
• Taupo genomų sekas duomenų bazę, naudojant GridFS
• Sumažintas atminties pėdsaką, skaičiuojant statistiką
• Naudoti porūšiams vietoj os.system
• mapq balai filtras turi būti 0

Kas naujo 1.1 versijoje:

• priduria paramą poros pabaigoje rašoma "

Kas naujo versijos 1.0.1:

• Pridėta parama MongoDB autentifikavimo

Reikalavimai :

• Python