Atidaryti Babelis yra atviro kodo, bendradarbiavimo, nemokamai ir Įvairioms biblioteka programinę įrangą, kuri buvo sukurta veikti kaip cheminis rinkinį specialiai sukonstruotas pripažinti daug kalbų cheminių duomenis. Tai tiesiog vadinamas & ldquo; Atviras Chemija rinkinys & rdquo;. Funkcijos iš glanceWith Open Babelio, vartotojai galės ieškoti, analizuoti, konvertuoti, ir kaupia duomenis iš chemijos, molekulinės modeliavimas, biochemijos, taip pat kitose susijusiose srityse. Jis palaiko platų bendrų cheminės failų formatų, įskaitant Mol2, SDF / mol, PBP, XYZ, šypsenos, ir LML.
Be to, Atviras Babelis suteikia pilnavertį programuotojas rinkinys, chemijos MIME paramą, SMARTS Matcher, lankstus atomą / obligacijų Typer, vandenilio naikinimui ir to, bitvector klasė, matricos ir vektoriaus transformacijas, taip pat molekulinio bandymo suite.Under gaubtą ir Palaikomos operacinės systemsOpen Babelis parašyta visiškai C ++ programavimo kalba. Ji & rsquo; sa tiesa cross-platform programinės įrangos, kuri palaiko GNU / Linux, BSD, Solaris, VSP, Microsoft Windows ir Mac OS X operacinėms sistemoms. Abu 32-bit ir 64-bit kompiuteriai oficialiai palaikoma rašymo metu this.Getting prasidėjo Atviros BabelFirst, mes primygtinai rekomenduojame jums įdiegti Open Babel naudojant iš anksto paruoštus dvejetainiai paketai iš numatytojo programinės įrangos saugyklų savo Linux distribucija. Jei jūsų GNU / Linux sistemos doesn & rsquo; t turi Open Babel programinę įrangą savo atpirkimo sandorių, tada jūs & rsquo; turi parengti ir montavimo programą, kuri naudoja universalias šaltinius archyvas teikiamomis Softoware.
Parsisiųsti siuntiniai (tar.gz archyvo), išgauti ją ant jūsų pasirinktą vietą, atidarykite terminalo emuliatorius, pereikite prie išgautų aplanką ir vykdyti & ldquo;. & Rdquo cmake; komanda (be kabučių) ir konfigūruoti projektą. Tada jūs turite paleisti ir ldquo; padaryti & rdquo; komandą, be kabučių, žinoma, kaupia ją. Įsitikinkite, kad cmake priemonė įdiegta į jūsų operacinę sistemą iki šių instrukcijų
Kas naujo , šioje laidoje:.
- Ši laida yra pagrindinis klaidą-FIX-išsiskyrimą ir turėtų būti stabili atnaujinti, primygtinai rekomenduojama visiems atvirų Babelio vartotojams. Daug klaidų ir patobulinimai buvo pridėta per pastaruosius metus nuo 2.3.0 išleidimo.
Kas naujo versijos 2.2.2:
- Ši laida yra pagrindinis bug-fix spaudai ir yra stabili atnaujinti, primygtinai rekomenduojama visiems atvirų Babelio vartotojams. Nors gali būti daug naujų funkcijų, daug avarijų ir kitų klaidas buvo nustatytos nuo 2.2.1.
- naujovinta naują Inchi 1,02 išleidimo pateikti standartizuotą Inchi ir InChIKey produkcija.
- Fiksuotas daug klaidų Stereochemija skaitant / rašant nusišypso. Tai yra dalis didesnio projekto, kuris bus baigtas 2.3 išleidimo.
- Fiksuotas rinkimas ir įrengimas Cygwin ir minGW platformų.
- Žymiai pagerėjo aromatiškumas ir Kekule obligacijų perleidimo.
- Geresnis 2D - & gt; 3D koordinačių kartos "
- Geresnis koordinuoti kartos naudojant --gen3d komandų eilutės veikimą
- Geresnis spektaklis koordinuoti kartos.
- Nauja --fillUC komandų eilutės operacija Babelio.
- Išspręsti pH priklauso nuo vandenilio to.
- Pridėta paramą skaityti vibracinių duomenis iš Molden, Molpro ir NWChem išvesties failus.
- Atnaujinta atominės spinduliai iš pastarųjų teoriniais skaičiavimais.
- Ištaisyta klaida skaitant gzip Mol2 arba XML failus.
- Uždaryti failus po klaidos. Išspręsti klaidą su Pybel kur išliks atidaryti failus.
- Daug daugiau pataisymai ir mažų funkcija pagerėjo. == Nauja Failų formatai == Import & Export:
- Molpro įvesties ir išvesties.
- VASP koordinuoti failai (CONTCAR ir POSCAR).
Kas naujo versijos 2.2.1:
- Patobulintos skriptų sąsajos, įskaitant Python 3 paramą ir pagerino Java ir C # paramą.
- Pridėta parama MACCS pirštų atspaudų. Dėka RDKit projektą.
- Daugelis pataisymai ir patobulinimai jėgos lauko kodą. Visų pirma, UFF jėga laukas įgyvendinimas turėtų dirbti daug daugiau molekules.
- Patobulintas 3D koordinačių kartos, ypač žiedų fragmentai. Jūs galite suteikti tai pabandyti su obgen naudingumas.
- Fiksuotas nuo PBP importo klaidų įvairovė atom tipų.
- Pridėta parama skaityti mokesčius ir spindulys iš PQR failų formatų.
- Pridėta parama skaitymo ir rašymo vieneto ląstelių PBP formatus.
- Naujas & quot; išvesties & quot; failo formatas atsižvelgiant bendrinis & quot; & quot ;, .out & quot; & quot ;, log ir & quot; Dat & quot; failus ir skaityti su atitinkamu failo tipą, remiantis turinį. Šiuo metu veikia labai gerai kvantinės chemijos paketai.
- Pridėta patobulintą klaidos tvarkymo ir atskaitomybės, kai negali įkelti failų formatus.
- Geresnis CIF failo formato palaikymas.
- Daug, daug, daug papildomų pataisymai ir maži patobulinimai.
Komentarai nerastas