FlexS prognozuoja konformaciją ir orientaciją vieną iš ligandų, lyginant su kita vieną. Be FlexS nuoroda-ligandas yra manoma, kad būti standi, tokiu būdu, ji turi būti skiriamas į konformacijos, kuri yra panaši į susijusios būklės. Superpozicija algoritmas FlexS reikia tik šiek tiek rankiniu būdu. Galite įtraukti šias žinias į skaičiavimus su FlexS atliekant atskirus veiksmus rankiniu būdu. Taigi, FlexS yra skirta interaktyvaus darbą ligandas poromis, taip pat už ligando-pagrįstas virtualios tikrinimo. Du pagrindiniai taikymas FlexS yra ligando super padėtį (pvz., Už CoMFA / QSAR) ir virtualios patikrą. Jei turite baltymų ir mažas molekulę privalomą jai (taip vadinamas atskaitos ligando), bet ne baltymo struktūrą, galite imtis atskaitos struktūrą kaip neigiamas pirštų atspaudų veikliosios svetainėje. FlexS nustato tarp tiriamojo ir kontrolinio struktūros panašumo juos suderinti. Virtualioje atrankos, turite atskaitos ligando ir junginių rinkinį ir jus domina pirmenybę junginius eksperimentiniais bandymais.
Komentarai nerastas