Gabedit

Gabedit yra grafinė vartotojo sąsaja su Gauso, Molcas, Molpro ir mpqc skaičiavimo chemijos paketus.
 
 Gabedit apima grafines priemones generuoti raktažodžius ir galimybes, molekulės specifikacijoms ir ITI įvesties skyriuose net labiausiai pažangių skaičiavimo tipų Gabedit apima pažangias molekulinė statybininkas.
 
 Jūs galite naudoti ją greitai eskizas molekulių ir juos išnagrinėti trijose dimensijose. Jūs galite kurti molekules atomas, žiedai, grupės, amino rūgščių ir nukleozidų. Jūs taip pat galite skaityti geometriją iš failo. Dauguma pagrindinių molekulinės failų formatai yra palaikomi.
 
 Gabedit apima Gauso, Molcas, Molpro ir mpqc apskaičiavimas sąrankos langą, kuris leidžia jums sukurti Gauso, Molcas, Molpro ir mpqc darbo vietų paprastai ir tiesiogiai būdu.
 
 Gabedit apima teksto redaktorius, skirtas redaguoti Molcas, Molpro, Gauso ir mpqc įvesties failus.
 
 Gabedit gali grafiškai parodyti iš Gauso, Molcas, Molpro, mpqc ir (iš dalies) ADT skaičiavimo rezultatus, įskaitant po įvairovė:
 
 ย ท Molekulinė orbitalės.
 ย ท paviršius nuo elektronų tankis, elektrostatinis potencialas, BMR ekranavimo tankio ir kitų savybių.
 ย ท paviršiai gali būti rodomas kietas, permatomas ir vielos tinklai režimais.
 ย ท paviršiai gali būti dažomi atskiru turtu.
 ย ท kontūrai (colorcoded).
 ย ท Lėktuvai (colorcoded).
 ย ท Dvimiesčio
 ย ท XYZ ašys ir pagrindiniai ašys molekulės.
 ย ท Animacijos normalių režimų, atitinkančių vibracinių dažnių.
 ย ท Animacijos iš geometrijos, paviršinius, dipolis, xyz ir pagrindinių krypčių molekulės rotacijos.
 ย ท Animacijos kontūrų.
 ย ท Filmas colorcoded plokštumose.
 
 Gabedit gali rodyti IR ir Ramano spektrus skaičiuojamas. Gabedit gali generuoti povray failą geometrija (atomų + obligacijų, įskaitant vandenilio anketa obligacijų), paviršių (įskaitant colorcoded paviršių), kontūrų, colorcoded plokštumose.
 
 Gabedit galite išsaugoti paveikslėlį PPM, BMP, (JPEG) ir PS formatu. Gabedit gali automatiškai generuoti paveikslėlių serijos animaciją (vibracijos, geometrijos konvergencijos, rotacijos, kontūrų, colorcoded plokštumų)

Kas naujo , šioje laidoje:

• Nedideli klaidos buvo ištaisytos.
• NWChem dabar palaikoma.
• gimtoji Windows žaidimai dabar palaikoma.

Kas naujo versijos 2.3.5.

• buvo nustatytas nedidelių klaidų,


• Atomai gali būti nustatyta per molekulinės dinamikos modeliavimas.
• Perėjimas iš Kairo į OpenGL piešimo geometrinių langą.
• Perėjimas iš gtkglarea į GtkGLExt.
• Lygiagretinimas naudojant OpenMP.

Kas naujo versijos 2.3.0.

• buvo nustatytas nedidelių klaidų,
• vartotojas gali skaityti orbitalės, geometrija ir įprastą režimą iš fchk Gauso failą.
• Galima skaityti orbitalės iš naujo MOPAC AUX failo formatu (įskaitant suspaustas formatas).
• Keletas naujų galimybių XYPlot ir ContoursPlot langai (įterpti tekstą, linijos, rodyklės, vaizdai, naujos temos ...).


• obligacijų ilgiai gali būti nustatyta per MD modeliavimas.
• Dalinis optimizavimas dabar įmanoma su MM potencialą.
• įgyvendinimas priemonė prognozuoti mases ir gausos apie izotopų tam tikros molekulės. Įgyvendinimas priemonė apskaičiuoti Elektrofilinis, Nukleofilinis ir radikalių jautrumą už molekulėje.

Kas naujo versijos 2.2.0:

• buvo nustatytas nedidelių klaidų,
• Visi geometriniai pokyčiai gali būti atšauktas ir perdarytas naudojant Undo ir bandykite (U / u arba Ctrl Z / Ctrl y)
• vartotojas turi pilną kontrolę obligacijų rodomas piešinio.
• molekulės atomo atomui brėžinys buvo supaprastinta.
• molekulės fragmentą fragmento brėžinys buvo supaprastinta.
• Gabedit skaityti JUNGTYS iš gabedit, Hin, PBP mol2 ir Mole failus.
• vartotojas gali nustatyti atstumą, obligacijų kampu ir Divplakņu kampu vertę.
• molekulinės dinamikos konformaciniu paieška įgyvendinama naudojant MM potencialą (Gintaro 99).
• molekulinės dinamikos konformaciniu paieška įgyvendinama naudojant Pusiau empirinė metodą (nuo atvirojo MOPAC ar PCGamess).
• Perėjimas iš GDK skolinimosi funkcijų Kairas:. Cross-įrenginio atvaizdavimas vektorinę grafiką;
• Kairas dabar naudojamas XYplot gabedit valdikliui (iki gabedit naudojama tempimo spektrų).
• Kairas dabar naudojamas geometrijos piešimo lange.
• Geometrija gali būti eksportuojami eps, PS, PDF arba SVG failas.
• XYplot lange kreivės gali būti eksportuojami eps, PS, PDF arba SVG failas.
• Nauja priemonė kompiuterinę atstumas tarp 2 taškų XYPlot langą. & Quot; Ctrl + Shift mygtuką & quot; gali būti naudojamas padaryti priartinimą ant XYPlot lango.
• nauja versija PCGamess (Firefly) Dabar palaikoma;

Kas naujo versijos 2.1.13:

• nedidelių klaidų buvo fixe "
• molekulinės dinamikos konformaciniu paieška įgyvendinama naudojant MM potencialą (Gintaro 99).
• molekulinės dinamikos konformaciniu paieška įgyvendinama naudojant Pusiau empirinė potencialą (naudojant MOPAC arba PCGAMESS).
• Galima optimizuoti geometriją interaktyviai naudojant MOPAC arba PCGamess pusiau empirinis metodas, iš Draw geometrijos lange;
• Perėjimas iš GDK skolinimosi funkcijų Kairas: Cross-įrenginio atvaizdavimas vektorinė grafika. Kairas dabar naudojamas XYplot gabedit valdikliui (iki gabedit naudojama tempimo spektrų). Kairas dabar naudojamas geometrijos piešimo lange.
• Geometrija gali būti eksportuojami eps, PS, PDF arba SVG failas. Iš XYplot lange kreivės gali būti eksportuojami eps, PS, PDF arba SVG failas.
• Nauja priemonė kompiuterinę atstumas tarp 2 taškų XYPlot langą. & Quot; Ctrl + kairįjį mygtuką & quot; gali būti naudojamas padaryti priartinimą ant XYPlot lango.
• nauja versija PC GAMESS / Firefly dabar palaiko "

Reikalavimai

• GTK +