Spindel yra alternatyvus metodas, skirtas biologinio identifikavimo grindžiamą ribosomos RNR (rRNR) genas regionuose ilgio. Apskritai, suderinimai dėl pirminės rRNR genų sekų iš skirtingų rūšių rodo kintančios regionus nukleotidų išsaugojimo ir variacijos, tiek nukleotidų pakaitų (paprastai vadinamų "SNP") ir įterpimo / išbraukta (INDEL) renginius. Iš indels rezultatus buvimas sekų skirtingų ilgių ir pristato spragas suvedimas, paprastai žymimas brūkšneliu "-".
Mūsų koncepcija biologiniam identifikavimo naudoja rRNR genų sekas taip: užkonservuotas yra naudojamas apibrėžti kintamas segmentus ("Spindel hiperkintamas sritis"), kurioje sekos derinys ilgiai yra būdinga kiekvienos rūšies ("Spindel profilio"). Taigi, kiekviena rūšis gali būti apibrėžta pagal unikalų skaitinė profilio.
Teoriškai, tik iš 6 hiperkintamas sritis vieni su 20 alelių (arba 11 regionų su 5 alelių kiekvienam) tyrimas yra pakankamai diskriminuoti visus eukariotinių rūšių Žemėje, kurios, kaip manoma, kad būti tarp 5 ir 15 mln skaičius. Praktiškai Spindel gali diskriminuoti 93,3% eukariotinių rūšių mažo vidurūšinei variacijos ir aukštos filogenetycznej rezoliucijos.
Komentarai nerastas