"ProtoType" yra šoninės scrolling shoot'em savo gryniausia forma. Taigi, jūs gaunate apkrovų priešų bangas, daugybę variklių, su kuriais juos naudokite, ir, žinoma, paskutinio boso pabaigoje kiekviename etape. Žaidime yra trys skirtingi sunkumo...

Jūs esate laboratorijos technikas dirba prie naujo eksperimento. Yra laboratorijoje nuo nelaimingų atsitikimų ir visi jūsų cheminių junginių buvo sumaišyti. Tai sukūrė forcefield, kad jūs negalite pabėgti. Jūs privalote sunaikinti visus ant lentynos...