CLC DNA Workbench

IEC DNR Workbench "sukuria programinę aplinką, leidžiančią vartotojams padaryti daug pažangių DNR sekos analizę, kartu su lygaus duomenų valdymą, ir puikus grafinių žiūrėjimo ir išvesties parinktis.
IEC DNR Workbench "yra prieinamas Windows, Mac OS X ir Linux platformose

Įranga .

• Bioinformatikos funkcijos Genų Workbench
• Lankstus peržiūra sukamaisiais molekulių.
• redaktorius grafiškai ir algoritmiškai avansu gruntas dizainas
• asamblėja DNR sekos duomenų,
• Molekulinė klonavimas;
• Automatinis SNP anotacija sekų;
• Paieškos ir atradimas DNR modelių,
• Vietinis sudėtingumo regionas analizuoja,
• Grįžtamieji vertimas iš baltymų genų, remiantis vertimų lenteles iš rūšių skaičius;
• Išplėstinė apribojimas fermentų analizė ir valdymas;
• Dot sklypas pagrįstos analizės,
• trumpa forma DNR statistika įskaitant charakteristikų tam tikros molekulės skaičius;
• NCBI seka duomenų paieška,
• Prieiga prie interneto informacijos iš PubMed,
• Kitos bioinformatikos funkcijos: "
• DNR, RNR ir baltymų sekos redaktorius rodyti tiek linijinių, tiek ir sukamaisiais molekulių;
• DNR, RNR ir baltymų suderinimas redaktorius;
• Interaktyvūs logotipai išilgai abiejų DNR, RNR ir baltymų išplanavimai;
• Serija perdirbimo analizę keliais sekų vienoje darbo vietoje pakopoje;
• Motyvas paieška,
• Raštas atradimas (nežinoma modeliai)
• Išplėstinė naujo derinimą ir nustatyti taškų lygiavimas variantas;
• Sekos logo grafikai kartu DNR, RNR ir baltymų suderinimai;
• Rankinis anotacija sekų;
• Integruota PubMed paieškos
• Web-based seka paieška naudojant BLAST "
• Dot sklypas pagrįstos analizės,
• Vietinis sudėtingumo regionas analizuoja ir sudėtingumo sklypai;
• Gap frakcija grafikai;
• G / C kiekis analizė ir grafikai;
• Projektų ir duomenų valdymas:
• Visas integracija duomenų įvedimo, duomenų valdymo, skaičiavimų rezultatais ir duomenų eksportas
• Išsamus istorija žurnalo "
• Visi failai tipai gali būti išsaugotas vietos projektus, ir pradėjo iš programos "
• Importas ir eksportas duomenis dideliu skaičiumi rinkmenų formatais,
• Galimybė dirbti kelių veikliųjų darbo vietoms metu, leidžianti vienu metu dirbti su keliais projektais;
• Importas pėdsakų duomenų failus ir kokybės balai iš automatizuotų DNR sequening Mašinų, naudojančių Standartinė chromatogramos Formatas ABI formatų ir doktorantūros formatą (Phred)
• Peržiūrimas ir ataskaitų: "
• Išplėstinė BLAST vaizdas;
• Advanced grafikai peržiūrėti;
• Išplėstinė histogramos rodinys "
• Išplėstinė taškas sklypas vaizdas;
• Ieškoti charakteristikų sekų ir išplanavimai;

Reikalavimai

• 256 MB RAM reikia,
• 512 MB RAM rekomenduojama
• 1024 x 768 rekomenduojama ekranas,

Apribojimai

• 4 savaičių visiškai funkcinis demo;