RAPTOR

RAPTOR yra novatoriškas programa, skirta tiksliam baltymų struktūros prognozavimas. Ji sujungia pažangias analizės įrankiai vienoje integruotą programinės įrangos sprendimas, ir pateikia tris skirtingus sriegimo metodus. Raptor unikalus sveikasis programavimo optimizavimo metodas yra efektyviausias ieškant struktūra šablonus tikslus su mažu homologinio ir sugeba generuoti aukštos kokybės modelius. Lengva naudoti sąsaja ir paprasta suprasti, E vertės idealiai tinka pradedantiesiems ir ekspertams. Visų pirma, intuityvus ekranas išvesties leidžia vartotojams suprasti rezultatus tiesiog iš pirmo žvilgsnio. Atsižvelgiant į taikinio baltymo seka, jei yra homologine baltymų žinomas 3D struktūrą, galima rasti naudojantis seka paieškos įrankius kaip PSI-BLAST, taip pat numatyta RAPTOR. Tikslinė struktūra yra tada pastatytas iš žinomo struktūrą; Tačiau, kai Homologija nėra reikšminga, ty mažiau kaip 25%, PSI-BLAST negali sugalvoti pasitikinti hitu. Skirtingai PSI-BLAST, kuris tiesiog daro sekos paiešką, baltymų sriegimo, susilanksto pripažinimą, pasinaudoja tiek homologijos ir struktūra informaciją. Jis nuskaito baltymų sekos su nežinoma struktūros nuo žinomų struktūrų duomenų bazę. Naudodami taškų funkciją ir atlieka suderinamumo analizę tarp trimačių struktūrų ir linijinių baltymų sekų, geriausias struktūrinis šablonas bus nustatyti iš kurių pastatyti sekos struktūrą. Kaip rezultatas, baltymų sriegimo suteikia puikią prognozę nei homologijos modeliavimas, kai yra nedidelis Homologija

Apribojimai .

riboto funkcionalumo