Padidinti Lite yra naujos kartos sekvenavimo duomenys kartografavimo ir vizualizacijos programinė įranga. Vartotojai įvesties pagalbos genomai ir Illumina / Solexa trumpas skaito failus arba AB "kietas spalvų erdvė skaito failus įvairių formatų, pavyzdžiui, * .fasta * .fastq * _seq.txt * .csfasta tt ZOOM išveda kartografavimo rezultatus šių trumpas skaito ant kontroline seka. Padidinti Lite greita ir tiksli kartografavimo branduolį remiantis naujai suprojektuota daug išdėstyti sėklų teorija. Tiek vieno pabaiga ir suporuotas pabaigos skaito įvairių ilgių nuo 15bp į 240bp gali būti tvarkomi. Leidžiama Bet nesutapimų ir vienas įterpimo / ištrynimo įvairių ilgių tarp perskaityti ir jos tikslinio regiono dėl atskaitos eilės numeris. Unikaliai zmapowane rezultatai ar geriausi (TOP N) rezultatai kiekvieną perskaitytą bus pranešta pagal minimaliomis nesutapimų ir Indel ilgio. Kokybės balai yra naudojami siekiant padidinti atvaizdavimo tikslumą. Remiantis kartografavimo branduolio, ZOOM Lite "leidžia vartotojams įkelti vietos skaityti duomenis ir nuorodos sekos duomenis, pasirinkite tinkamą parametrų, procesas didelės apimties duomenis lygiagrečiai tarp iki keturių procesorių, stebėti einamąsias užduotis, saugoti žemėlapių rezultatus, peržiūrėti grafikus kartografavimo rezultatais, kartografavimo rezultatus arba * .BED arba * .GFF failų formatai toliau geodeziniai su UCSC naršyklė sekti informaciją. Mapping rezultatai gali būti peržiūrėtas bet kuriuo norimu mastu, iš Skaityti gylio diagramoje per visą chromosomą detalus sekos trasos tarp skaito ir nuoroda seka. Vartotojai lengvai pereiti į regionų interesus tiesiog per paspaudimu ir vilkite ar nemirksi. Padidinti Lite yra iš Padidinti Studio programinės įrangos darinys
Kas naujo , šioje laidoje.
Versija 1.5 apima SAM eksporto formatą, architektūra prisitaikyti, geriau kodo optimizavimas, mažesnis Programa dvejetainis dydis ir modernizuotos dabase engining geresnių rezultatų.
Komentarai nerastas