Bioinformatikos Palyginamasis sistema yra bandymas sukurti protingą testavimo sistemą, testai, ir duomenis, kad galutiniai vartotojai ir pardavėjai zondas savo sistemų veikimą.
Ką mes bandome padaryti, tai sukurti testavimo sistemą ir pagrindinę rinkinį testus, kurie visi gali atsisiųsti ir naudoti zondas specifinius elementus sistemų veikimą.
Be to, šių testų šaltinis yra pateikiamas pagal GPL ir talpinami Bioinformatics.org ir plečiasi informatikos LLC idėja yra, kad galutiniai vartotojai, vartotojų, sistemos kūrėjai, ir kitus lengvai kurti ir naudoti prasmingus tyrimus matavimo ir tiuningo priežasčių ,
Džo Landman iš Scalable Informatikos LLC sumanyta idėja ir parašė originalius kodus. Mes ieškome papildomų kontrolinių kodų pasiūlymus, testai, duomenų rinkinių ir tt
Dabartiniai pradiniai testai yra keletas NCBI BLAST veikia keletas hmmer veikia, ir kitų įvairovė. Mes planuojame įtraukti clustalw, Tandem X!, Įvairių chemijos, dinamiką ir susiję bandymai, taip pat keletas kitų.
Testai, kaip antai Linpack ar HPL tiesiog neteikia prasmingų rodiklių ar prognozavimo modelius aukštų rezultatų informatika. Deja, nei padaryti daug daugiau naujausių ir orientuota bandymų skaičių.
Tai problema, nes Linpack ir HPL specialiai išbandyti įvairiais matricos operacijas, kur jūs turite iš tikrųjų reguliariai atminties prieigos modelius ir tikslių matematinių operacijų efektyvumą.
Šie kodai yra labiausiai naudinga palyginti su kodais sunkiaisiais slankiojo kablelio operacijų ir sluoksniuota atminties srautą. Šie kodai buvo ne skirtos išsamios sistemų lyginamąją analizę, kurioje disko I / O, atminties latentinis ir kiti veiksniai visų prisidėti prie veiklos klausimais.
Geriausi testai yra tie, kurie yra labiausiai panašus į kodais jums bus paleisti į mašiną. Bandymai patys turėtų būti pagrįstų artėjimą nekilnojamojo vykdymo kodą, naudojant realius duomenis. Jums gali tekti pare jį atgal, siekiant gauti realius paleisti kartus.
Jūs turite būti pagrįstai sutrumpinti duomenų dydžių. Vieno bandymo nepasako, kaip jūsų sistema svarstyklės, ir vienas iš šio testą egzistavimo priežasčių yra specialiai leidžia jums išbandyti efektyvumą, o jūs padidinti įvairius darbo krūvį.
Jūs retai gauti inertiškos sistemos klasteris, todėl mes rekomenduojame, kad jūs bandote paleisti kaip realus veiklos aplinką, kaip įmanoma. Į inertiškos sistemos bazinis yra gerai, bet ji gali nustatyti Jūsų lūkesčius nepagrįstai.
Top
Komentarai nerastas