Sojų pasta (mišinys izoformų) yra tikimybinis sistema parašyta Python kad quantitates raiškos lygį & nbsp; ir alternatyviai sujungta genų iš RNR-Seq duomenis ir nustato skirtingai reguliuojamų izoformų ar egzonų visoje mėginių.
Modeliuojant generatyvinių procesą, kuriame rašoma gaminami iš izoformų į RNR-Seq, Sojų pasta modelis naudoja Bajeso išvadą apskaičiuoti tikimybę, kad skaityti kilęs iš tam tikros izoformos.
Sojų pasta naudoja numanomą priskyrimą perskaitysime izoformų į quantitate užtikrinamojo rinkinį alternatyvių mRNR izoformų gausą. Pasikliautinieji intervalai virš skaičiavimais galima gauti, kuris kiekybiškai vertinti šių įverčių patikimumą.
Žiūrėkite http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ už Miso vadovą ir dokumentų,
Reikalavimai :.
- Python
Komentarai nerastas