Staden paketas yra visiškai išvystyta rinkinys DNR sekos surinkimas (Gap4), redagavimo ir analizės įrankiai (skiriamųjų) Unix, Linux, MacOSX ir MS Windows.
Dėl Gap4 priekio Yra buvę keletas nepilnametis prisijungti susijusios
patobulinimai, kaip jis balai prisijungia Ieškoti Vidaus Sujungti ir
funkcionalumas align mygtuko Prisijunk redaktorius.
Taip pat nuo to į gap4 yra įvairių pakeitimų io_lib (
biblioteka All I / O įvairių pėdsakų failų formatų). Su to
naujos hash_exp programą dabar ji leidžia eksperimentas failai būti
sujungiamos kartu ir indeksuojami. Eksperimento failų vardai sąrašas
stilius turėtų būti pateikta gap4, tačiau su sąlyga, kad EXP_PATH aplinką
kintamasis buvo nustatytas teisingai gap4 galės atnešti individualus
sekas iš į sujungtųjų eksperimentas failą
archyvas. Patobulinimai vartotojo sąsaja tai vis dar reikia
padarė.
454 SFF archyvai dabar geriau palaikoma. Į defsult 454 indeksai
dabar dirbti, nors hash_sff programa gali būti naudojama teikti
alternatyva indeksavimo strategija (galbūt greičiau kai kuriais atvejais).
Gap4 ir Trev taip pat turi kitą pėdsakų rodymo stilių pėdsakai, kad
Turiu 1 pavyzdį scan (x4 kanalai) už bazinės skambutį. Šiuo atveju, jis gali
taip pat atkreipti 4 pasitikėjimo 1 iš bazės vertybes vietoj. Šie gebėjimai
leis geriau integruoti Solexa pėdsakų, kai lengviau
prieinama.
Plius, žinoma, įprastas derinys klaidų ir Nežymūs. Žiūrėti
pilnas Pakeitimai registruojami detales (per SourceForge svetainėje).
Kiti reikšmingų pokyčių
Gap4
Komentarai nerastas