Seal Python modulis, kuris suteikia sekos suderinimą Hadoop.Sandarinimo yra MapReduce paraišką biologinės sekos derinimą. Jis veikia Hadoop (http://hadoop.apache.org) per Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce ir HDFS API Hadoop. ...
TRMiner yra Python programa, kuri siekia mokslo duomenų kuratorių, & nbsp;. Tai leidžia greitai genėti dideles kolekcijas mokslinių publikacijų ir sakinių atitinkamas tam tikros kasybos tikslas.Tai pasiekiama dviem etapais. Pirma, tekstai tranlated į...
Pysam yra Python modulis skaitymo ir manipuliuoti Samfiles & nbsp;. Tai lengvas įvynioti į samtools C-API.Quick Start Guide yra čia. Rasti čia Detalesnė dokumentai.Klausimai ir komentarai yra labai laukiami ir turėtų būti nusiųsta į pysam vartotojų grupei...
PySCeS yra projektas, sukurtas Triple-J Group Molekulinė ląstelės fiziologijos & nbsp;., Siekiant išbandyti modelį ir suprasti sudėtingus procesus ir sistemas, kurie sudaro gyvą ląstelę Įranga :. tekstas grindžiamas modelis aprašymas kalba ...
grundalas yra Python API skaityti dvejetainių duomenų failus sukurta naudojant Goby Next-Gen duomenų valdymo sistemą.Paprastai šis katalogas yra dalis visiškai Goby paketą, galima iš:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Pilnas paketas apima Java kodą. Jei...
SSuMMo yra funkcijų, kuriomis aplink keletą kartų naudojant hmmer priskirti sekas taksonų & nbsp biblioteka;. Rezultatai yra labai komentuojami medžiai, rodantys rūšis / platinimas genties toje bendruomenėje.Programas, įtrauktas su kodo apima priemones,...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) yra efektyvus programa, kuri išlygina santykinai trumpus nukleotidų sekas: prieš ilgą kontroline seka, kaip antai žmogaus genomo.Programinė įranga įgyvendina du algoritmus, BWA-trumpas ir BWA-SW. Buvę darbai užklausai sekas...
durpės programų užfiksavimo, prognozuoti ir analizuoti biofizinius charakteristikas baltymų komplektą.Žr http://enzyme.ucd.ie/PEAT dokumentacijos, instrukcijų, ekrano ir tt Reikalavimai :. ...
OpenElectrophy yra sistema, skirta palengvinti manipuliavimui, laikymui ir analizę elektrofiziologiniais duomenis. Jis gali importuoti duomenis iš įvairių failų formatų ir laikyti juos į vieną SQL tipo duomenų bazėje.Analizės įrankiai įtraukti...
NEO (Neuroniniai Ensemble objektai) ir projekto pateikti bendrą rinkinį bazinių klasių turi būti naudojamos nervų duomenų analizė, su vis OpenElectrophy, NeuroTools o gal ir kitus projektus su panašių tikslų artimesnės kartu siekiant.Du pagrindiniai...
