Viršus Bioinformatika Už Linux
OpenElectrophy yra sistema, skirta palengvinti manipuliavimui, laikymui ir analizę elektrofiziologiniais duomenis. Jis gali importuoti duomenis iš įvairių failų formatų ir laikyti juos į vieną SQL tipo duomenų bazėje.Analizės įrankiai įtraukti...
durpės programų užfiksavimo, prognozuoti ir analizuoti biofizinius charakteristikas baltymų komplektą.Žr http://enzyme.ucd.ie/PEAT dokumentacijos, instrukcijų, ekrano ir tt Reikalavimai :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) yra efektyvus programa, kuri išlygina santykinai trumpus nukleotidų sekas: prieš ilgą kontroline seka, kaip antai žmogaus genomo.Programinė įranga įgyvendina du algoritmus, BWA-trumpas ir BWA-SW. Buvę darbai užklausai sekas...
SSuMMo yra funkcijų, kuriomis aplink keletą kartų naudojant hmmer priskirti sekas taksonų & nbsp biblioteka;. Rezultatai yra labai komentuojami medžiai, rodantys rūšis / platinimas genties toje bendruomenėje.Programas, įtrauktas su kodo apima priemones,...
grundalas yra Python API skaityti dvejetainių duomenų failus sukurta naudojant Goby Next-Gen duomenų valdymo sistemą.Paprastai šis katalogas yra dalis visiškai Goby paketą, galima iš:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Pilnas paketas apima Java kodą. Jei...
PySCeS yra projektas, sukurtas Triple-J Group Molekulinė ląstelės fiziologijos & nbsp;., Siekiant išbandyti modelį ir suprasti sudėtingus procesus ir sistemas, kurie sudaro gyvą ląstelę Įranga :. tekstas grindžiamas modelis aprašymas kalba ...
Pysam yra Python modulis skaitymo ir manipuliuoti Samfiles & nbsp;. Tai lengvas įvynioti į samtools C-API.Quick Start Guide yra čia. Rasti čia Detalesnė dokumentai.Klausimai ir komentarai yra labai laukiami ir turėtų būti nusiųsta į pysam vartotojų grupei...
TRMiner yra Python programa, kuri siekia mokslo duomenų kuratorių, & nbsp;. Tai leidžia greitai genėti dideles kolekcijas mokslinių publikacijų ir sakinių atitinkamas tam tikros kasybos tikslas.Tai pasiekiama dviem etapais. Pirma, tekstai tranlated į...
Seal Python modulis, kuris suteikia sekos suderinimą Hadoop.Sandarinimo yra MapReduce paraišką biologinės sekos derinimą. Jis veikia Hadoop (http://hadoop.apache.org) per Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce ir HDFS API Hadoop. ...
avalanchetoolbox yra identifikuoti ir aprašyti filialų procesus, pavyzdžiui, neuronų griūčių rinkinys Reikalavimai :. ...