MetagenomeDB yra Python biblioteka skirta lengvai laikyti, gauti ir komentuoti metagenomic sekas & nbsp;. MetagenomeDB veikia kaip abstrakcija sluoksnio viršaus MongoDB duomenų bazę. Ji suteikia API kurti ir modifikuoti ir prijungti dviejų tipų objektų,...
SSuMMo yra funkcijų, kuriomis aplink keletą kartų naudojant hmmer priskirti sekas taksonų & nbsp biblioteka;. Rezultatai yra labai komentuojami medžiai, rodantys rūšis / platinimas genties toje bendruomenėje.Programas, įtrauktas su kodo apima priemones,...
tigreBrowser yra genų ekspresijos modelis naršyklė rezultatus Tigre R paketo (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Įrengimas: tigreBrowser reikalingas Python versija> = 2.5. tigreBrowser galima montuoti su šią...
MACS2 yra modelis, pagrįstas analizės įrankis lustų Seq duomenis.Su sekos metodų tobulinimo, chromatino imunoprecipitacijos po didelio našumo sekos (lusto Seq) vis populiarėja studijuoti genomo baltymų DNR sąveiką. Siekdama spręsti galingas chip-Seq...
edittag yra taikymas kolekcija projektavimo rinkiniai redaguoti metrinių seka žymės, tikrinimo seka žymės raumeningumo redagavimo metrikos, ir integruoti seka žymes platformos konkrečios sekos adapteriai ir PGR pradmenis. edittag skiriasi nuo kitų...
MacMolPlt yra šiuolaikinės grafikos programa braižymo 3-D molekulines struktūras ir normalus režimai (vibracija). Šiuolaikinės...
picme yra Python paketas, kuriame yra programos apskaičiuoti ir nubraižyti filogenetinė informatyvumą didelėms duomenų bazėms. Diegimas Šiuo metu, pats lengviausias būdas įdiegti programą yra:Git Git klonas: //github.com/faircloth-lab/picme.git / kelias /...
SyntenyMiner yra prašymas vizualizuoti ir apklausti palyginimus tarp kelių pilnų genomo sekos. Sąsaja suteikia laivybai vaizdas rungtynes į nuorodą genomo seka. Seka rungtynių tarp chromosomos skirtingų genomų gali būti toliau nagrinėjamas atsižvelgiant...
ProteinShop yra interaktyvus įrankis manipuliuoti baltymų struktūras. Ji buvo sukurta greitai sukurti baltymų konfigūracijų rinkinį, naudojant žmogaus žinias ir intuicija. Šios konfigūracijos gali būti atliekamas vietos ar globalios optimizacijos. Nors...
PySCeS yra projektas, sukurtas Triple-J Group Molekulinė ląstelės fiziologijos & nbsp;., Siekiant išbandyti modelį ir suprasti sudėtingus procesus ir sistemas, kurie sudaro gyvą ląstelę Įranga :. tekstas grindžiamas modelis aprašymas kalba ...
